La Unidad de Investigación Arkos nace en Octubre de 2005 con la finalidad de cumplimentar con la tarea sustantiva de generar conocimiento mediante la investigación al interior del Centro de Estudios Universitarios Arkos.

Esta Unidad fue concebida originalmente al interior del Círculo de Calidad Docente y del Consejo Directivo de la institución. Está integrada por un equipo docente-investigador que busca, generar, impulsar, facilitar y difundir la investigación en las diversas áreas del conocimiento con que trabaja la universidad, bajo la filosofía transdisciplinaria que plantea el Modelo Educativo de la Universidad Arkos, pero también, retoma los principios establecidos por la Federación de Instituciones Mexicanas Particulares de Educación Superior (FIMPES) en relación con los tipos de programa que se pretende impulsar.