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Los seminarios se trabajan con grupos mixtos de estudiantes de las diferentes carreras y son acompañados por un equipo docente transdisciplinar (conformado por miembros de los talleres de I-A) que sustentado en la transdisciplinariedad, apoya a los estudiantes para ejercitarse en una nueva forma de pensamiento (complejo) para abordar el trabajo de investigación y hacer sus tesis de licenciatura. La dinámica de trabajo se basa en la dialógica, la intersubjetividad y el cruzamiento de saberes. Junto con los “Talleres transdisciplinarios” representan el “diezmo transdisciplinario” propuesto por Morin y la UNESCO para las universidades.

Algunas investigaciones desarrolladas y defendidas por los estudiantes ante jurado son:

Autor Preguntas de Investigación Publicación
Chavarín, Rubén (2009) ¿Beneficios o perjuicios de la reforma agraria al artículo 27 de la Constitución Política Mexicana, en la Comunidad Indígena de Chacala? Tesis de licenciatura en Derecho.  ¿Cuáles son los impactos de la reforma agraria sobre las comunidades ejidales? ¿Cuáles son las implicaciones sociales y económicas de la reforma que modifica elrégimen comunal?  
Disponible en: http://www.ceuarkos.com/Vision_docente/chacala57.pdf
Arteaga Aréchiga, Arturo (2010) Creación del macrolibramiento en Puerto Vallarta,  Afectaciones Sociales y Ecológicas en las zonas  en que se construirá. Tesis de licenciatura en Ciencias de la Comunicación. Preguntas: ¿Qué afectaciones sociales y ambientales tendrá la ejecución del proyecto del macrolibramiento? ¿Qué rol juegan los medios de comunicación en la documentación y divulgación de la problemática hacia la población?  
Disponible en: http://www.ceuarkos.com/Vision_docente/resenatesis57.pdf
Palacios, Edgar y Castillón, Mónica (2012) Investigación sobre el estado actual del estero ‘El Salado’ y su potencial de desarrollo turístico sustentable. Tesis de licenciatura en Administración de Empresas Turísticas. Preguntas: ¿Cuál es el estado actual del estero El Salado, en términos de su conservación y protección? ¿Cuáles serían los impactos ambientales, sociales y turísticos de un proyecto turístico sustentable en el Estero el Salado?  
Disponible en: http://www.ceuarkos.com/Vision_docente/salado68.pdf